醌类化合物是指分子内具有不饱和环二酮结构（醌式结构）或容易转变成这种结构的一类天然有机化合物。醌类化合物是天然产物中一类比较重要的活性成分，是许多中药如丹参、大黄、番泻叶、何首鸟、芦荟、决明子、虎杖等的有效成分，主要分布于50多科100多属的高等植物中，在低等植物藻类、菌类、地衣的代谢产物中也有分布，动物及细菌中也偶有发现。