原料的选择是制备中药化学对照品首先遇到的问题。不同的原料其共存成分不同，所需成分的含旦不同，会产生不同的分离效果和收率。原料选用得当，会收到事半 功倍的效果。植物的不同品种，不同采收时期，由于受遗传及生态环境的影响，化学成分含量会有很大的差异。对要选用的原料，事先要经过鉴定，确保所用原料的 品种正确，所用品种的产地相对稳定。   
   松脂二葡萄糖甙(Pinoresinol diglucoside)是杜仲(Ecommia ulmoides ()liv)降压的有效成分，它仅存于树皮的韧皮部，含量约为0.2%.其木质部、栓皮.果实及叶中均不含有。
    伊贝母(Fritillaria pallidiflora Schrenk) 鳞茎中的西贝碱(sipeimine )含量在一日内有显著的变化。新鳞茎及地上茎叶含量最高点在中午12时.最低点在夜间12时.最高和最低值相差约3倍，所以伊贝母的采挖时间以中午为最好。
  通过上述松脂二葡萄糖甙和西贝碱的例子，我们知道原料品种、产地、药用部位和采收期等因素对制备中药化学对照品的影响。这些都是提取、分离前必须考虑的问题。